2013
İsim değiştirildi
Sahipataspor'un isim değiştirmesiyle Afjet Afyonspor kuruldu.
2013-2014
Süper Amatör Lig
Afyon Süper Amatör Ligde başarılı bir sezon geçirmiştir.
2013-2014
Ligi 2.lik ile bıraktık.
Kulübün ilk başkanı Salih Sel’dir. Afjet Afyonspor'un ilk antrenörü Ufuk Süer'dir. Afjet Afyonspor 2013-2014 sezonunda Süper Amatör Lig'de 22 maçta 64 puanla 12 takım içinde ligi 1. bitirmiş ve Bölgesel Amatör Lige yükselmiştir. 2014-2015 Bölgesel Amatör Lig sezonu 7. Grupta 26 maçta 54 puanla 14 takım içinde Bodrum Belediyesi Bodrumspor'un ardından ligi 2. bitirmiştir.
2015-2016
3. Lig'e yükseldik
Kırgızistan millî takımında oynayan Mirlan Murzaev ve Toma Tabatadze (Gürcistan) transferleriyle Bölgesel Amatör Lig 7. Grup'u birinci sırada tamamlayıp play off maçında Halide Edip Adıvar'ı 2-0 yenerek tarihinde ilk kez 3. Lig'e yükseldi.
2016-2017
2. Lig'e yükseldik
2016-17 sezonunda 3. Lig 3. Grup'ta şampiyon olarak tarihinde ilk kez 2. Lig'e yükseldi.
2017-2018
1. Lig'e yükseldik
2017-18 sezonunda Kırmızı Grubu 3. tamamlayan takım play-off müsabakaları final maçında Sakaryaspor'u 2-1 mağlup ederek 1. Lig'e yükseldi. Böylece 3 sene üst üste Şampiyon olarak lig atlamış oldu.
2018-2019
2. Lig'e düştük
2018-19 sezonunda 1. Ligde ilk sezonunda ligde tutunamayıp tekrar 2. Lige düşmüştür.